Kebersihan dan keindahan lingkungan merupakan cerminan dari kedisiplinan serta kesehatan mental para penghuninya. Di Pondok Pesantren Pesd, kesadaran ini diwujudkan melalui sebuah agenda rutin yang melibatkan seluruh elemen pondok tanpa terkecuali. Kegiatan yang dinamakan kerja bakti akbar ini bukan sekadar kegiatan bersih-bersih biasa, melainkan sebuah momentum untuk memperkuat rasa gotong royong dan tanggung jawab sosial santri terhadap tempat tinggal mereka selama menuntut ilmu.

Agenda besar ini biasanya dilaksanakan sekali dalam sebulan atau menjelang hari-hari besar Islam. Seluruh santri, pengurus, bahkan para ustadz turun tangan langsung ke lapangan. Mereka dibagi menjadi beberapa kelompok dengan area tugas yang spesifik. Ada yang bertanggung jawab membersihkan area drainase, merapikan taman, mengecat ulang pagar, hingga membersihkan langit-langit masjid. Fokus utama dari kegiatan ini adalah untuk wujudkan lingkungan yang bersih, sehat, dan nyaman untuk mendukung proses belajar mengajar.

Bagi pesantren Pesd, keindahan lingkungan memiliki kaitan erat dengan produktivitas santri. Lingkungan yang kotor dan tidak tertata dapat memicu timbulnya berbagai penyakit dan menurunkan semangat belajar. Sebaliknya, dengan adanya pesantren yang asri, santri akan merasa lebih betah dan pikiran menjadi lebih segar saat harus berhadapan dengan kitab-kitab yang tebal. Pepohonan yang hijau dan bunga yang terawat di area pesantren memberikan suplai oksigen yang baik, yang sangat dibutuhkan untuk metabolisme otak para penuntut ilmu.

Nilai pendidikan yang paling menonjol dari kerja bakti akbar ini adalah hilangnya sekat-sekat senioritas. Di hadapan tumpukan sampah atau rumput yang liar, semua memiliki derajat yang sama sebagai pelayan lingkungan. Santri senior memberikan contoh yang baik kepada juniornya tentang cara bekerja yang efektif dan ikhlas. Mereka belajar bahwa melakukan pekerjaan kasar demi kepentingan umum adalah sebuah kemuliaan, bukan sesuatu yang memalukan. Karakter rendah hati ini adalah salah satu output penting yang ingin dihasilkan oleh manajemen Pesd.